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長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA。通過與DNA、RNA或蛋白質結合，在表觀遺傳、轉錄及轉錄后等水平調控基因表達，與人類疾病發生發展有密切聯系。lncRNA-seq主要分析研究細胞或者組織在某個特定時期轉錄出的所有lncRNA和mRNA。

技術路線

案例分析

采用RNA-seq測序技術，對14個中國前列腺癌病人的轉錄組進行全面分析，結果在每個樣本中平均發現了1599個已知的lncRNA。通過腫瘤樣本和正常樣本進行分析，發現了406個有差異表達的lncRNA。該研究找到了中國人群特異的融合基因，同時還鑒定了大量的差異表達的lncRNA。通過對lncRNA和基因表達的關系分析顯示，lncRNA有可能有轉錄調控之外的其他功能。這些研究結果為進一步了解前列腺癌的診斷、發病演化機制和種族差異性提供了新的線索。

圖1 137個差異表達的lncRNA對基因表達的分析

圖2 lncRNA中的DD3，FR0257520，FR0348383，MALAT1在前列腺癌和正常對比

參考文獻

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[2]Ren S, Peng Z, Mao J H, et al. RNA-seq analysis of prostate cancer in the Chinese population identifies recurrent gene fusions, cancer-associated long noncoding RNAs and aberrant alternative splicings[J]. Cell research, 2012, 22(5): 806-821.

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