科研服務

基因組/代謝組學

首頁 > 科研服務 > 基因組/代謝組學

轉錄組測序

時間：2020-07-21 15:02:00 瀏覽：37664次

轉錄組測序是基于HiSeq平臺，對待特定組織或者細胞在某個時期轉錄出來的所有mRNA進行測序，即可研究已知基因，亦能發掘新基因，全面快速地獲得mRNA序列和風度信息。

技術路線

案例分析

案例通過RNAseq技術全面解析乳腺癌組織中的可變剪切形式

乳腺癌組織由特定形式的轉錄本發揮特殊功能，本研究應用RNAseq技術獲得了三種典型乳腺癌組織TNBC、non-TNBC和HER2陽性乳腺癌的轉錄本信息。該研究發現了新可變剪切形式和可變剪切后的新轉錄本，進一步研究發現，乳腺癌組織與正常乳腺組織在轉錄本表達水平和啟動子轉移水平存在顯著差異，并RT-PCR驗證CDK4，LARP1 , ADD3和PHLPP2等轉錄本形式。該研究第一次系統研究了不同亞型乳腺癌組織轉錄本利用可變剪切形式和轉錄本特異表達的情況。

圖1 三種亞型乳腺癌中可變剪切形式統計

參考文獻

Eswaran J, Horvath A, Godbole S, et al. RNA sequencing of cancer reveals novel splicing alterations [J]. Scientifc reports, 2013, 3.

威斯騰生物服務項目

分子生物學檢測	蛋白質與免疫學	動物實驗
實時熒光定量PCR	單克隆抗體制備	帕金森疾病模型
免疫共沉淀（Co-IP）	多克隆抗體制備	抑郁癥動物模型
ELISA（酶聯免疫吸附法）技術	Western-blot 實驗服務	脊髓損傷模型
生化指標檢測	蛋白雙向電泳實驗服務	腦外損傷模型
雙熒光素酶報告基因檢測	原核蛋白表達純化	骨神經損傷模型
染色質免疫共沉淀（ChIP）	真核蛋白表達純化	心肌缺血模型
GST pull Down	ITRAQ定量蛋白質組學	心力衰竭模型
	SLAC蛋白組學	肺動脈高血壓動物模型
		高血壓模型
病毒包裝	實驗課題整體外包	粥樣動脈硬化模型
過表達/干擾慢病毒包裝純化	整體課題外包	大腦中動脈阻塞模型
過表達/干擾腺病毒包裝純化	細胞整體實驗外包	慢性之氣管炎模型
逆轉錄病毒包裝純化	動物整體實驗外包	過敏性哮喘模型
腺相關病毒包裝純化		肺炎大鼠模型
		肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片	原代細胞培養	肝纖維化模型
細胞因子芯片	骨髓間充質干細胞培養	膽結石模型
BioPlex懸浮芯片	脂肪干細胞培養	急性胰腺炎模型
生長因子芯片	心肌成纖維細胞培養	急性腎衰竭模型
炎癥因子芯片	軟骨細胞培養	體內血栓模型
血管生成因子芯片	血管內皮細胞培養	關節炎模型
凋亡因子芯片	神經元細胞培養	I型和II型糖尿病模型
趨化因子芯片	內皮組細胞原代培養	裸鼠成瘤
HuProt TM 20K人類蛋白組芯片		基因編輯動物
	電生理相關服務	動物整體實驗服務
	膜片鉗實驗
細胞生物學檢測	高通量測序	代謝組學
細胞原代培養	mRNA測序	氣相色譜GC/MS
MTT檢測	LncRNA測序	液相色譜LC/MS
細胞凋亡檢測	全基因組測序	核磁共震NMR
細胞周期檢測	RNA-Seq測序
細胞克隆形成實驗	外顯子測序	影像學相關實驗
Transwell細胞遷移/侵襲	16s擴增子測序	Micro-CT
流式分選	Small RNA測序	小動物活體成像
CCK8/XTT檢測	宏基因組測序	核磁共振
臺盼藍檢測細胞活性	單細胞測序	PET-CT
藥物篩選細胞學實驗	circleRNA測序
細胞粘附性檢測	甲基化測序	基因編輯動物
細胞劃痕實驗		條件性敲除小鼠/大鼠
細胞生物學整體實驗		全基因敲除小鼠/大鼠
細胞成管實驗
病理檢測	CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入	基因芯片
掃描電鏡	基因定點突變細胞系	LncRNA芯片
透射電鏡	單基因敲除細胞系	miRNA芯片
HE染色	多基因敲除細胞系	mRNA芯片
免疫組化	目的基因敲入細胞系	甲基化芯片（限人和小鼠來源樣本）
Tunel（原位末端凋亡法）檢測	報告基因敲入細胞系	SNP芯片（限人和小鼠來源樣本）
激光共聚焦	miRNA/LncRNA敲除細胞系
免疫熒光
Masson染色	CRISPR/Cas9動物敲除/敲入
原位雜交	基因敲除大鼠/小鼠
熒光原位雜交	基因敲入大鼠/小鼠
特殊染色（PSA、茜素紅、阿爾新藍等）
行為學檢測	藥物篩選服務項目	藥效學評價
曠場實驗	高通量自動藥物篩選平臺	抗腫瘤藥物藥效學評價
重復性刻板行為檢測	細胞高內涵藥物篩選平臺	心血管系統藥物藥效學評價
動物跑臺檢測	蛋白質組學靶標研發平臺	泌尿系統藥物藥效學評價
強迫游泳	分子藥理研究平臺	內分泌系統藥物藥效學評價
	生物膜片鉗藥物篩選平臺	抗炎免疫藥物藥效學評價
	常規藥物體外篩選

【本平臺合作項目】
分子生物學、細胞生物學、基因敲出/入、模式動物、SPF動物保種、病理學檢測、免疫學檢測、影像學檢測、原代培養、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學、代謝組學、高通量高內涵篩選、藥效學評價、藥理毒理學實驗、慢病毒包裝與穩轉株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學分析、知識產權服務！
【全國免費熱線】400-675-6758
【電話】 023-65316016,023-65316556
【郵箱】 china-western@163.com
【官網網址】www.hbasx.com
【地址】重慶市高新區二郎創業大道高科創業園D棟2樓

原代細胞培養

CRISPR/Cas9細胞敲除/入

模式與轉基因動物

動物醫學實驗

蛋白質組學

基因組/代謝組學

分子生物學檢測

細胞生物學檢測

基因/蛋白芯片

動物行為學檢測

影像學檢測服務

病理學檢測

蛋白質互作服務

文庫構建服務

體內藥效學評價

轉錄組測序