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ChIP-seq測序

    ChIP-seq采用特異性抗體對目的蛋白進行免疫沉淀后，分離與其結合的基因組DNA片段，并通過高通量測序，在全基因組范圍內尋找目的蛋白特異結合的DNA位點，且可基于多個樣品進行差異比較分析及特異蛋白結合位點的序列偏好性分析。

ChIP-seq優勢：

用于在全基因組范圍中研究蛋白特異結合的DNA片段，組蛋白修飾和表觀遺傳修飾的技術，研究這三個主題有助于洞悉蛋白對基因表達的調控以及染色體的功能結構。具有“覆蓋全，周期快，分析科學”的優勢，已廣泛應用于人、小鼠、酵母、水稻、擬南芥等物種的研究。

ChIP-seq操作步驟：

1、研究對象的選?。?/span>

2、提取DNA樣本，DNA量≥20ng;

3、ChIP-seq文庫構建；

4、PE150測序（10-20Mb）;

5、信息分析，通過對IP下來的合格DNA樣本，建庫測序，獲得高質量reads，根據SCC曲線判斷IP效果，通過motif分析判斷IP的特異性以及分析的可信性，高效預測相關基因，進行功能富集分析、預測特異蛋白的功能，組蛋白染色體結合圖譜以及DNA的表觀修飾。

服務周期：

50天

案例分析

案例：雌***受體結合異常與乳腺癌臨床試驗的相關性研究
雌***受體（ER）可與相關基因結合形成復合體并移位到細胞核結合下游基因激活它們轉錄，為腫瘤生長助力。在許多乳腺患者體內，就是因為該受體影響了基因的功能，從而引發致癌連鎖反應。現在常用的***等乳腺癌治療藥物，就是通過阻斷雌***受體對基因的作用而發揮效果。但在不少患者身上，這種藥物的效果并不理想。本研究基于高通量平臺的染色質免疫共沉淀技術ChIP-seq全基因組范圍內尋找ER結合位點，從而鑒定雌***結合模式是否在患者腫瘤中存在差異。

circRNA測序

環狀 RNA（circRNA）是一類特殊的 RNA 分子，也是 RNA 領域的研究熱點。與傳統的線性 RNA（linear RNA，含 5’和 3’末端）不同，circRNA 分子呈封閉環狀結構，不受 RNA 外切酶影響，表達更穩定，不易降解。近幾年的研究表明，circRNA 在生物的生長發育、疾病的發生發展、對外界環境的抵御等方面具有重要的調控作用。由于 circRNA 的閉合環狀特性，通過去除 total RNA 中的 rRNA 和線性 RNA 分子，可以特異地富集 circRNA 分子后測序，更有針對性地分析受檢樣本中特定的 circRNA 譜、circRNA 剪接模式、組間差異和分子功能等。

服務特色

• 應用范圍廣：可以檢測幾乎任何動植物的 circRNA
• 環狀 RNA 全覆蓋：高深度覆蓋，可以檢測到低豐度的 circRNA
• 生物信息學分析：強大的生物信息學團隊，提供circRNA 鑒定、circRNA 功能預測、circRNA 分子標志物篩選等深入分析易讀性強的數據報告

推薦測序模式

• Hiseq X Ten，PE150
• 推薦10 Gb/樣本

威斯騰實驗服務流程

威斯騰生物服務項目

【本平臺合作項目】
分子生物學、細胞生物學、基因敲出/入、模式動物、SPF動物保種、病理學檢測、免疫學檢測、影像學檢測、原代培養、細胞藥篩、CRISPR/Cas9基因編輯、基因芯片、高通量測序、蛋白組學、代謝組學、高通量高內涵篩選、藥效學評價、藥理毒理學實驗、慢病毒包裝與穩轉株建立、SiRNA與納米載藥、ChIP、CO-IP、生物信息學分析、知識產權服務！
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